公共卫生学院前身为1958年成立的锦州医学院公卫组，下设流行病教研室、卫生学教研室、核医学教研室。1984年撤销核医学教研室。2000年流行病教研室、卫生学教研室合并为预防医学教研室。2009年与人文社科学院合并组建公共卫生管理学院。2014年12月成立公共卫生学院。
学院2009年获批预防医学本科专业，2010年招收第一批本科生。2011年获批“公共卫生与预防医学”一级学科硕士点，同年招收第一批公共卫生与预防医学硕士研究生。预防医学专业2021年入选辽宁省一流本科专业建设点。目前在校本科生300人，硕士研究生36人。
学院现下设6个教研室、1个预防医学实验教学中心和4个行政科室。承担本科生、研究生、留学生层次课程20余门，年均教学时数约6000学时。
学院不断加强学科建设，以“慢性病发病机制及精准防控研究”为主要学科方向，下设四个研究方向：儿童肥胖及相关慢性病研究、环境外源化学毒物的风险机制研究、慢性病流行病学研究及防控、营养与食品安全。
预防医学实验教学中心，面积600 m²，拥有教学仪器设备300余台件，总值1000余万元。实现理化分析、微生物检验、环境监测、毒性鉴定、营养成分测定、分子生物学等教学功能，增强学生大卫生、大健康理念，培养学生的创新意识和实践能力。
学院现与锦州市、营口市、阜新市、盘锦市、铁岭市、朝阳市、葫芦岛市疾病预防控中心和检验检测中心等单位建立实习基地。学院与辽宁省、锦州市、营口市、朝阳市、葫芦岛市疾病预防控制中心共建研究生培养基地。
依托公共卫生学院，学校于2022年12月成立“锦州医科大学儿童青少年健康促进协同创新中心”，落实《锦州医科大学全面振兴新突破三年行动方案》“科创引航工程”，提升科研协同攻关和服务经济社会发展能力，于2023年4月21-23日成功承办“2023年儿童青少年健康促进国际学术研讨会”。
学院积极弘扬“崇德 笃行 博学 求真”的院训精神，深化教育教学改革，落实“立德树人”根本任务，为公共卫生领域输送大批应用型人才，搭建中青年教师发展成长平台，努力建设高水平公共卫生学院。
学院下设专业如下：预防医学
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